甲子，天干和地支配合可以用来纪年、纪月、纪日。在医学上，主要是用干支来纪年。十天干和十二地支相互配合，谓之甲子：故曰：“天气始于甲，地气始于子。子甲相合，命曰岁立，谨候其时，气可与期，，（《素问·六微旨大论》）‘天干与地支的配合是天干在上，地支在卜，按干支的顺序向下排列。天干的第一位是甲，地支的第一位是子，两者配合起来便是甲子。从甲子始依次推算到癸亥，共得六十次，便称为一周或叫一个甲子：六十年后（癸亥止）又复从甲子纪年起，如此交替轮转：在六十年中，天干往复轮周六次（10干x6次＝60年），地支往复轮周五次（12支X5次=60年）：用以纪年，六十年就是一个周期：故曰：“天以六为节，地以五为制，周天气者，六期为一备，终地纪者，五岁为一周……五六相合而七百二十气，为一纪，凡三十岁，千四百四十气，凡六十岁，而为一周，不及太过，斯皆见矣”（《素问·天元纪大论》）。用以纪日，用纪天的十干反复六次，和纪月的十二支反复五次，排成甲子，再乘以六，便为一年三百六十五日的大概日数。“天有十日，日六竟而周甲，甲六复而终岁，三百六十五日法也”（《素问·六节脏象论》）。
天干地支，五六相合，构成六十年一个气候变化的大周期。前三十年，包括七百二十节气（以一年二十四节气计算），是为一纪，后三十年，亦七百二十节气，凡一千四百四十节气，共计六十年（也称六十甲子）：甲子中的天干，主要是主五运的盛衰，甲子中的地支主要是司六气的变化，所以讲述五运六气，不能离开干支甲子。
