心主神明论是在中医理论的指导下，用脏象学说一元化的阐述人体复杂的生命活动规律的假说。它认为人的生命活动最高主宰是“心神”，心理活动也不例外。人体的心理活动和生理活动，就是统一在“心神”之中。心神不仅了主导了脏腑机能活动的协调，人对客观世界的认识以及由体验而产生的情感，也都是在心神主导之下，以五脏为生理基础而产生的。因此说“心为五脏六腑之大主，而总统魂魄，兼赅意志。”“心主神明论”是在“形神合一论”的基础上，将“人身之神”依附于“脏象之心”，故心才成为“君主之官”而主神明。在理论上，它和“脑髓说”只不过是在“神”所依附的“形”这一点上有所分歧，而作为“神为生命之主”这一基本观点是一致的。由于“心主神明论”不仅很好地阐述了人体复杂生理活动的整合控制、心理活动的有序进行，而更重要的是突出了心理和生理的统一，因此这一在整体观思想指导下，以脏象论为基础所形成的假说，在中医长期临床实践中，很好地发挥了防治疾病的实际效果。至于如何用现代科学方法进一步深入研究，那将是我们今后长期的任务。
