一、种子繁育
中草药用种子繁育最为普遍。种子繁育技术简便，利于引种驯化和新品种培育。但是，种子繁育的后代容易产生变异，开花结实较迟，尤其是木本中草药用种子繁育所需年限很长。所以要发展药用植物良种繁育，一是加速繁育新的优良品种，以便换已在生产上应用的老品种；二是保持新品种的优良性，防止混杂和退化。如元胡的块茎分“母元胡”和“子元胡”，生产上必须用“子元胡”作种才能获优质高产。又如浙贝母，因繁育系数很低，为保证种子的质量，生产上将商品地和种子地分开培植。地黄农家品种金状元，经过茎尖培养所得无病毒苗与原品种相比，病害轻，产量高，可使因感染病毒而退化的品种复壮。故应用生物新技术进行中草药优良品种的培育（包括多倍体育种和其他育种技术）和克隆化快速繁育，然后按国家GAP要求建立大面积生产基地，是根本上提高我国中草药质量问题的有有效途径之一。
二、营养繁育
营养繁育在药用植物栽培中约占35％，如分根、分株或用鳞茎(贝母)、块茎(何首乌)、珠芽(半夏)等繁育。有些中草药收种子非常困难或不结种子，如雅连、川芎等，生产上一直用无性繁育。无性繁育比用种子繁育生长快，产量高，生长年限短，并能保持母本优良性状，故多采用。如贝母用鳞茎繁育一年一收，种子繁育五年才能收。但有时长期无性繁育易引起品种退化，如地黄、山药等，须注意随时去杂、去劣，适时倒栽，防止退化。天麻的长期无性繁育，品种退化严重，用天麻有性繁育(树叶菌床法)，生活力提高，既解决了品种退化问题，又解决了种源缺乏的问题，产量和质量并增。
三、组织培养
中草药的组织培养就是把分离出来的中草药材组织（如根、茎、叶的段、片、块等）放入含有一种合成培养基的瓶中，于无菌操作条件下使之生长或发育，它利用药用植物体细胞的再生能力，可培育出保持原品种的固有性状和特性的植株。是现代最先进的中草药快速繁育技术，在中草药GAP（中药材生产质量管理规范）种植中，常用组织培养的方法进行无病毒植株育种和生产无公害的绿色中草药。
