蒙药的内容主要包括：五元、六味、药力、药性、药物功能。
五元蒙药学以古代朴素的五元（土、水、火、气、空）为理论基础。认为植物发育生长与“五元”有密切的关系。土是植物的基础，是植物吸养之源，生命之根本。水是植物所需养料的溶媒，也是植物体内运化因子，有滋润营养植物、促进其生长的作用。火在植物内为能量、
六味药物有不同的味道，这些味道，是五元在药物形成的过程中，经过复杂作用而造就的，概括起来可分为甘、酸、咸、苦、辛、涩六种。
药力药物品种虽然繁多，但不外寒热两性，即阴性和阳性两大类型。
药性药物的性能或药理作用。蒙医用药的基本原则就是利用蒙药的性能调整机体内部的“赫依”、“希拉”、“巴达干”的偏盛偏衰。
药物功能有柔、重、温、脂、固、寒、钝、凉、和、稀、燥、淡、热、轻、锐、涩、动等17种。
蒙医根据药物的寒热两性，派生出8种药物性能，最后又发展成为药物的17种功能。在临床实践中运用这17种药物功能去克制疾病的20种基本性质。
